在现代商业环境中，企业间的合作是获取竞争优势的重要途径。然而，由于技术研发投入的差异，合作关系有时会出现裂痕。这种差异可能源于资金、资源、战略规划等方面的不同，从而导致合作双方在研发进度、成果共享等方面的分歧。要有效化解这一矛盾，需要采取以下几个步骤：

首先，沟通是解决问题的关键。当企业间因为技术研发投入差异导致合作关系出现问题时，双方应该及时进行沟通，明确各自的立场和期望。通过坦诚的对话，了解对方的关切点和困难，寻求共同的解决方案。

其次，重新评估合作协议。合作双方应该回顾并重新审视原有的合作协议，看看是否需要根据当前的情况进行调整。这可能包括重新分配研发投入的比例，调整成果共享的机制，或者对未来的研发方向进行重新规划。

再次，寻求第三方支持。如果双方难以在内部达成共识，可以考虑寻求第三方的帮助。这可能是行业专家、咨询公司或者调解机构，他们可以提供中立的意见，帮助双方找到平衡点。

此外，建立共同的研发目标也是重要的。合作双方应该共同设定清晰、可实现的研发目标，并为之共同努力。这有助于增强合作关系，减少因投入差异而产生的矛盾。

最后，定期评估与调整。合作过程中，企业应该定期对研发进展和合作关系进行评估，根据实际情况进行必要的调整。这种动态的管理方式有助于及时解决合作过程中的问题，保持合作的健康和高效。

综上所述，当企业间因技术研发投入差异导致合作关系出现裂痕时，通过有效沟通、重新评估合作协议、寻求第三方支持、建立共同的研发目标以及定期评估与调整，可以有效化解这一矛盾，维护合作关系，实现共同的发展目标。